Родился 10 марта 1913 года в станице Новолеушковской в семье крестьянина. В Советской Армии служил в 1935-1937 годах. На фронт попал в декабре 1941 года, где сражался с немецкими захватчиками в составе 359-го стрелкового полка 5 –й дивизии.

В ночь на 30 января 1945 года старший сержант Яковченко под сильным огнем противника, по изрытому снарядами льду, первым в полку со своим взводом переправился на левый берег реки Одер. Отбивая контратаки врага, бойцы взвода удерживали плацдарм до подхода подкрепления.

За проявленное мужество и храбрость Иван Ефимович Яковченко получил звания Героя Советского Союза. Награжден орденом Ленина, медалями.

После войны фронтовик жил и работал в городе Тихорецке. Умер в апреле 1979 года.